WWW.DOC.KNIGI-X.RU
БЕСПЛАТНАЯ  ИНТЕРНЕТ  БИБЛИОТЕКА - Различные документы
 

«УТВЕРЖДАЮ: Ректор _ А. И. Новиков «_» 2012 г. М.П. Основная образовательная программа послевузовского профессионального образования (аспирантура) по ...»

Государственное бюджетное образовательное учреждение

высшего профессионального образования

«Омская государственная медицинская академия»

Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации

УТВЕРЖДАЮ:

Ректор

_________________ А. И. Новиков

«___» ____________ 2012 г.

М.П.

Основная образовательная программа

послевузовского профессионального образования

(аспирантура)

по специальности: микробиология (03.02.03)

по отрасли: биологические науки (03.00.00) Присуждаемая ученая степень Кандидат наук Омск-2012 Основная образовательная программа послевузовского профессионального образования (аспирантура) (далее - ООП ППО (аспирантура)) разработана в соответствии с:

Приказом Министерства образования и науки Российской Федерации от г. № 1365 «Об утверждении федеральных государственных требований к структуре основной профессиональной образовательной программы послевузовского профессионального образования (аспирантура)»

Инструктивным письмом Министерства образования и науки Российской Федерации № ИБ-733/12 от 22.06.2011 г. «О формировании основных профессиональных образовательных программ послевузовского профессионального образования».

на основе паспортов научных специальностей с учетом особенностей сложившейся научной школы академии и программ кандидатских экзаменов.

ООП ППО (аспирантура) одобрена решением Ученого совета ГБОУ ВПО ОмГМА Минздравсоцразвития России (протокол № ____ от «___»____________20____г.).



Составители:

Таран Н.И., к.м.н., доцент, зав. отделом аспирантуры и докторантуры (ФИО, уч. степень, звание, должность) (подпись)

Согласовано:

Ливзан М.А., д.м.н., доцент, проректор по НИР (ФИО, уч. степень, звание, должность) (подпись) Патюков А.Г., д.м.н., профессор, проректор по учебной работе (ФИО, уч. степень, звание, должность) (подпись) Содержание Общая характеристика основной образовательной программы послевузовского профессионального образования (аспирантура) (далее ООП ППО (аспирантура)) по отрасли биологические науки (микробиология–03.02.03) Структура ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ОД.А.03), обязательная дисциплина – микробиология – 03.02.03. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа кандидатского экзамена (цикл КЭ.А.00), обязательная дисциплина – микробиология – 03.02.03. Модуль ООП ППО (аспирантура) Требования к научно-исследовательской работе аспиранта Требования к государственной аттестации аспиранта Рабочая программа (цикл ОД.А.00), обязательная дисциплина – история философии и науки – ОД.А.01. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа кандидатского экзамена (цикл КЭ.А.00), обязательная дисциплина – история и философия науки (ОД.А.01). Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ОД.А.00), обязательная дисциплина – иностранный язык (с кандидатским экзаменом) – ОД.А.02, Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ОД.А.00), дисциплина по выбору аспиранта – медицина основанная на доказательствах – ОД.А.04. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ОД.А.00), дисциплина по выбору аспиранта – статистический анализ в медицинских исследованиях – ОД.А.05. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ОД.А.00), дисциплина по выбору аспиранта – клинический лабораторный анализ и диссертация – ОД.А.06. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ОД.





А.00), дисциплина по выбору аспиранта – информационные технологии в науке и образовании – ОД.А.07. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ФД.А.00), факультативные дисциплины – клиническая патофизиология – ФД.А.01. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ФД.А.00), факультативные дисциплины – психофизиология – ФД.А.02. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ФД.А.00), факультативные дисциплины – биохимия и молекулярная биология – ФД.А.03. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл ФД.А.00), факультативные дисциплины – прикладные аспекты клинической фармакологии и фармакогенетики в организации клинических исследований – ФД.А.04. Модуль ООП ППО (аспирантура) Рабочая программа (цикл П.А.00), педагогическая практика – П.А.01. Модуль ООП ППО (аспирантура) Общая характеристика основной образовательной программы послевузовского профессионального образования (аспирантура) по отрасли биологические науки

1.Цели аспирантуры.

В соответствии со ст. 19 ФЗ «О высшем послевузовском профессиональном образовании» аспирантура является одной из форм подготовки научных и научнопедагогических кадров высшей квалификации в области медицины для науки, медицинской промышленности и профессионального образования медицинского профиля.

Целями подготовки аспиранта, в соответствии с существующим законодательством, являются:

углубленное изучение методологических, клинических и медикосоциальных основ медицинских наук;

формирование умений и навыков самостоятельной научноисследовательской и научно-педагогической деятельности;

совершенствование философского образования, ориентированного на профессиональную деятельность;

совершенствование знания иностранного языка, ориентированного на профессиональную деятельность.

2.Ученая степень присуждается при условии освоения ООП ППО (аспирантура) и успешной защиты научно-квалификационной работы (диссертации на соискание ученой степени кандидата наук) – кандидат медицинских наук.

3.Нормативный срок освоения ООП ППО (аспирантура) по специальности 03.02.03

- микробиология при очной форме обучения составляет 3 года, при заочной форме обучения – 4 года.

4.Требования к знаниям и умениям выпускника аспирантуры.

Выпускник аспирантуры должен быть широко эрудирован, иметь фундаментальную научную подготовку, владеть современными информационными технологиями, включая методы получения, обработки и хранения научной информации, уметь самостоятельно формировать научную тематику, организовывать и вести научноисследовательскую деятельность по избранной научной специальности.

5.Требования к уровню подготовки, необходимому для освоения ООП ППО (аспиратора) и условия конкурсного отбора.

Лица, желающие освоить основную образовательную программу подготовки аспиранта по специальности 03.02.03 - микробиология, должны иметь высшее профессиональное образование.

Лица, имеющие высшее профессиональное образование, принимаются в аспирантуру по результатам сдачи вступительных экзаменов на конкурсной основе. По решению экзаменационной комиссии лицам, имеющим достижения в научноисследовательской деятельности, отраженные в научных публикациях, может быть предоставлено право преимущественного зачисления.

Порядок приема в аспирантуру и условия конкурсного отбора определяются действующим Положением о подготовке научно-педагогических кадров и научных кадров в системе послевузовского профессионального образования в Российской Федерации.

Программы вступительных испытаний в аспирантуру разрабатываются кафедрами академии в соответствии с Федеральными государственными образовательными стандартами высшего профессионального образования.

Образовательная программа реализуется кафедрой:

микробиологии, вирусологии и иммунологии.

Паспорт специальности.

Шифр специальности: 03.02.03 – микробиология Формула специальности: Микробиология - область науки, занимающаяся исследованием теоретических основ жизнедеятельности микроорганизмов:

наследственности, изменчивости, метаболизма, закономерности взаимоотношения с окружающей средой и живыми организмами, распространения в природе, взаимодействия с факторами внешней среды и живыми организмами, их роли в круговороте веществ.

Микробиология изучает бактерии, а также определенные группы дрожжеподобных и мецелиальных грибов, микроскопические водоросли, простейшие. Народнохозяйственное значение состоит в использовании микроорганизмов для: борьбы с вредителями, болезнями человека, животных и растений; повышения плодородия почв, силосования кормов, получения гормонов, витаминов, полисахаридов, антибиотиков, белка, белкововитаминных добавок, аминокислот, ферментов, вакцин, моноклональных антител и др.

7.Области исследований:

1.Проблемы эволюции микроорганизмов, установление их филогенетического положения.

2. Выделение, культивирование, идентификация микроорганизмов.

3. Морфология, физиология, биохимия и генетика микроорганизмов.

4. Исследование микроорганизмов на популяционном уровне.

5. Обмен веществ микроорганизмов.

6. Сапрофитизм, паразитизм, симбиоз микроорганизмов.

7. Экология микробных сообществ, сапрофитных, патогенных, условнопатогенных микроорганизмов в окружающей среде. Абиотические и биотические факторы.

8. Использование сапрофитных бактерий антагонистов, продуцентов биологически активных веществ для оптимизации микробиоценозов.

9. Участие микроорганизмов в круговороте веществ.

10. Использование микроорганизмов в народном хозяйстве, ветеринарии и медицине.

Отрасль наук: биологические науки, медицинские науки.

–  –  –

Примечания:

) Одна зачетная единица соответствует 36 академическим часам продолжительностью 45 минут. Максимальный объм учебной нагрузки аспиранта, включающий все виды аудиторной и внеаудиторной (самостоятельной) учебной работы, составляет 54 академических часа в неделю.

) Дисциплины по выбору аспиранта (ОД.А.04, ОД.А.05 и т.д.) выбираются им из числа предлагаемых образовательным учреждением, реализующим образовательную программу послевузовского профессионального образования.

) Факультативные дисциплины (ФД.А.00) не являются обязательными для изучения аспирантом. Время, отведенное на факультативные дисциплины, может быть частично или полностью использовано в других разделах образовательной составляющей.

) Подготовка к защите диссертации на соискание учной степени кандидата наук (ПД.А.00) включает оформление диссертационной работы и представление е на кафедру (в научный совет, отдел, лабораторию, сектор) или в совет по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук.

) Без учета каникул.

2.Срок освоения ООП ППО (аспирантура) при очной форме обучения 156 недель, в том числе:

–  –  –

Лицо считается успешно окончившим аспирантуру в случае выполнения следующих требований:

полностью выполнен индивидуальный учебный план;

сданы кандидатские экзамены;

завершена работа над диссертацией и оформленная диссертация представлена в Диссертационный совет.

Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Омская государственная медицинская академия»

Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации

–  –  –

Обязательная дисциплина – микробиология (03.02.03) Модуль основной образовательной программы послевузовского профессионального образования (аспирантура) по специальности 03.02.03 - микробиология Для аспирантов всех форм обучения (очная, заочная) Кафедра обучения: микробиологии, вирусологии и иммунологии

–  –  –

Программа обсуждена и одобрена на заседании кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии ГБОУ ВПО ОмГМА Минздравсоцразвития России (протокол № ____ от __________ 2012 г.).

Программа утверждена на заседании Центрального координационного методического совета ГБОУ ВПО ОмГМА Минздравсоцразвития России (протокол № _____ от «_____»

____________20___г.).

Составители:

Наумкина Е.В., д.м.н., профессор кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии (ФИО, уч. степень, звание, должность) (подпись)

Рецензент:

–  –  –

Согласовано:

Рудаков Н.В., д.м.н., проф., зав. кафедрой микробиологии, вирусологии и иммунологии (ФИО, уч. степень, звание, должность) (подпись) Таран Н.И., к.м.н., доцент, зав. отделом аспирантуры и докторантуры (ФИО, уч. степень, звание, должность) (подпись)

–  –  –

Настоящая рабочая программа обязательной дисциплины «Микробиология» модуль ООП ППО (аспирантура) разработана на основании ФЗ от 22.08.1996 г. № 125-ФЗ «О высшем послевузовском образовании», Положения о подготовке научнопедагогических и научных кадров в системе послевузовского профессионального образования в Российской Федерации (утв. приказом Министерства общего и профессионального образования РФ от 27.03.1998 г. № 814 (в действующей редакции));

составлена в соответствии с приказом Минобрнауки России № 1365 от 16.03.2011 г. «Об утверждении Федеральных государственных требований к структуре основной профессиональной образовательной программы послевузовского профессионального образования (аспирантура)».

2.Цели и задачи изучения дисциплины

Цель изучения микробиологии состоит в овладении знаниями методологических, клинических и медико-социальных основ медицинских наук, а также в углубленном изучении теоретических и методологических основ микробиологии и формировании умений и навыков самостоятельной научно-исследовательской и научно-педагогической деятельности.

При этом задачами дисциплины являются:

углублнное изучение методологических, клинических, медико-социальных основ медицинских наук;

формирование умений и навыков самостоятельной научно- исследовательской и педагогической деятельности;

совершенствование философского образования, ориентированного на профессиональную деятельность;

совершенствование знания иностранного языка, ориентированного на профессиональную деятельность4 подготовка и защита диссертации на соискание учной степени кандидата медицинских (биологических) наук.

3.Требования к уровню освоения содержания дисциплины

Аспирант должен знать:

правила работы в микробиологической лаборатории;

принципы классификации микробов, бинарную номенклатур;

особенности ультраструктуры микробов, функции отдельных структур, их химический состав;

основные функции микробов: питание, дыхание, размножение, ферментативная активность; влияние окружающей среды на микробы; питательные среды, методы культивирования бактерий и вирусов, методы выделения чистых культур аэробных и анаэробных бактерий;

роль микроорганизмов в круговороте веществ в природе;

состав микрофлоры организма человека и ее значение в норме и при развитии патологических процессов;

действие на микробы физических и химических факторов; понятие «асептика» и «антисептика»; методы стерилизации и аппаратуру;

химиотерапевтические вещества; антибиотики; классификация антибиотиков по способу получения, химической структуре, механизму и спектру действия; современные представления о молекулярном механизме действия антибиотиков; осложнения антибиотикотерапии; антибиотикорезистентность микроорганизмов, ее механизмы;

учение о наследственности и изменчивости микробов; виды генетической рекомбинации и использование рекомбинантов в получении вакцинных штаммов, продуцентов антибиотиков, ферментов, гормонов; внехромосомные факторы наследственности и их роль в формировании лекарственной устойчивости и патогенности;

роль микроорганизмов в развитии инфекционного процесса и условия его возникновения;

значение свойств микробов и состояния макроорганизма в развитии инфекционного процесса;

этиологию и патогенез основных инфекционных и оппортунистических заболеваний;

защитные силы организма (специфические и неспецифические факторы защиты);

свойства антигенов; структуру, химический состав, свойства антител; классы иммуноглобулинов; формы иммунного ответа; механизмы гиперчувствительности замедленного и немедленного типов; реакции иммунитета; современные методы оценки иммунного статуса. Особенности колонизационной резистентности;

историю создания вакцин, современную классификацию вакцин; принципы их получения и применения; лечебно-профилактические сыворотки. Тактику применения иммунобиологических препаратов при заболеваниях человека.

Аспирант должен уметь:

соблюдать правила инфекционного контроля и безопасности в практической работе;

использовать методы микроскопии в микробиологических исследованиях;

применять культуральный метод исследования для выделения чистой культуры микроорганизмов;

проводить забор клинического материала для лабораторных исследований неинвазивными способами и транспортировать до микробиологической лаборатории;

стерилизовать и проводить предстерилизационную обработку инфицированных материалов.

Аспирант должен владеть:

начальным опытом педагогической работы, методикой проведения занятий и чтения пробных лекций;

методическими примами в той области знаний, которая определена темой аннотации его диссертационной работы;

опытом проведения собственных экспериментальных и лабораторных исследований, составления отчтов и статистической обработки результатов исследования;

опытом подготовки, обработки и представления результатов собственных научных исследований на уровне научной конференции, конгресса (на русском и иностранном языках);

необходимой практикой изучения отечественной и иностранной литературы, подготовкой собственных научных публикаций;

основными методологическими принципами философского и психолого-педагогического анализа проблем современной микробиологической науки.

–  –  –

ГБОУ ВПО ОмГМА Минздравсоцразвития России обеспечивает каждого аспиранта основной учебной и учебно-методической литературой, необходимой для успешного освоения образовательной программы по специальности 03.02.03. – «Микробиология». Собственная библиотека академии удовлетворяет требованиям Примерного положения о формировании фондов библиотеки высшего учебного заведения, утвержденного приказом Минздравсоцразвития России от 27.04.2000 г. № 1246.

Кафедра микробиологии, вирусологии и иммунологии располагает учебнометодическим кабинетом, в котором имеет обширный фонд научной литературы по специальности «Микробиология», учебно–методические пособия, материалы научных конференций и т.д.

7.1.Основная литература

–  –  –

Кафедра микробиологии, вирусологии и иммунологии располагает материальнотехнической базой, обеспечивающей проведение всех видов теоретической и практической подготовки, предусмотренных учебным планом аспиранта, а также эффективное выполнение научно-исследовательской работы.

–  –  –

Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Омская государственная медицинская академия»

Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации

–  –  –

Обязательная дисциплина - микробиология (03.02.03) Модуль основной образовательной программы послевузовского профессионального образования (аспирантура) по специальности 03.02.03 - микробиология Для аспирантов всех форм обучения (очная, заочная) Кафедра обучения: микробиологии, вирусологии и иммунологии

–  –  –

История, предмет и задачи микробиологии.

Этапы развития микробиологии (эвристический, морфологический, физиологический, иммунологический, молекулярно-генетический). Связь микробиологии с иммунологией и другими дисциплинами. Основополагающая роль А. Левенгука, Л.

Пастора, Р. Коха, II. Эрлиха, Д.И. Ивановского, И.И. Мечникова и других ученых в развитии микробиологии и смежных дисциплин: открытие Л. Левенгуком микроорганизмов; роль работ Л. Пастора в развитии общей, медицинской, техническом, сельскохозяйственной микробиологии и иммунологии; роль работ Р. Коха в медицинской микробиологии (выделение чистых культур, методы микроскопии, триада Генле-Коха и др); открытие вирусов Д.И. Ивановским; введение принципа элективных культур, открытие автотрофии (С.Н. Виноградский), развитие экологии микроорганизмов;

обнаружение ферментативной активности в бесклеточных препаратах дрожжей (Бюхнер) и развитие биохимии дрожжей; развитие генно-инженерных исследований; открытие витаминов, сульфамидных препаратов, антибиотиков и других биологически активных препаратов, а также создание биотехнологических производств; вклад отечественных ученых в развитие микробиологии - исследования В.Л. Омелянского, Г.Н. Габричевского, Н.Ф. Гамалеи, А.Н. Лебедева, СП. Костычева, Г.А. Надсона, В.Г. Будкевича, Д.К.

Заболотного, Н.Г. Холодного, Б.А. Исаченко, В.Н. Шапошникова, Н.Д. Иерусалимского, Н.А. Красильникова, П.Ф. Здродовского, В.Д. Тимакова, З.В. Ермольевой и др.

Соотношение и взаимосвязь бактериологии, вирусологии, микологии, протозоологии иммунологии и аллергологии. Значение методов молекулярной биологии, цитологии, физиологии, биохимии и генетики в изучении микробов. Характеристика общей, медицинской, фармацевтической, санитарной, технической, сельскохозяйственной, ветеринарной, водной, почвенной, геологической и космической микробиологии; связи между разделами микробиологии. Палеомикробиология.

Современные представления об эволюции микроорганизмов.

Морфология и структурно-функциональная организация клеток микроорганизмов.

Основные типы клеток; клетки прокариот и эукариот. Структурно-функциональные особенности эубактерий, архебактерий и различных представителей эукариот.

Основные структурные компоненты клеток.

Цитологические методы: методы окраски микроорганизмов и методы микроскопии (люминесцентная, темнопольная, фазовоконтрастая, электронная и др.). Цитохимические методы. Приготовление препаратов для электронной микроскопии: тотальные препараты, ультратонкие срезы, реплики (криофрактография), контрастирование препаратов.

Строение клеток прокариотных микроорганизмов (эубактерий и архебактерий).

Особенности морфологических типов клеток.

Клеточная стенка бактерий. Строение, химический состав и функции. Строение, функции липополисахарида и пептидогликана. Стенки эубактерий и архебактерий. Синтез и сборка компонентов клеточных стенок. Образование S-, R-, L-форм бактерий, протопластов и сферопластов, некультивируемых форм бактерий.

Капсулы и фимбрии (пили). Химический состав, структура и функции.

Жгутики, подвижность бактерий. Строение и химический состав жгутиков.

Периплазматические жгутики спирохет; строение и функции. Скользящая подвижность некоторых бактерий и ее механизм. Хемо-, фото- и магнитотаксисы.

Периплазматическое пространство у грамотрицательных бактерий. Состав, структура и функции.

Мембраны бактерий, структура и функции: цитоплазматическая мембрана;

внутрицитоплазматические мембранные структуры бактерий производные цитоплазматической мембраны; фотосинтезирующий мембранный аппарат; тинакоиды, хлоросомы, родопсиновые мембранные структуры галобактерий; мембранные структуры метилотрофных, нитрифицирующих и других бактерий; мезосомы бактерий; наружная мембрана грамотрицательных бактерий.

Цитоплазма бактерий. Химический состав, физико-химические показатели, структура. Включения: полифосфаты (волютин), гликоген, гранулеза, гранулы полибетагидрооксимасляной кислоты, белковые кристаллы, элементарная сера, карбоксисомы, магнитосомы, фикоциановые гранулы цианобактерий. Рибосомы бактерий. Состав, строение и функции. Различия рибосом эубактерий, архебактерий и эукариот. Различия в аппарате трансляции у грамположительных и грамотрицательных эубактерий и архебактерий. Газовые вакуоли уникальные структуры прокариотной клетки.

Ядерный аппарат бактерий нуклеоид. Состав и структура. Бактериальная хромосома. Репликация ДНК и сегрегация нуклеоидов при делении клеток. Связь нуклеоида с мембранными структурами клетки. Особенности ядерного аппарата архебактерий.

Особенности физиологии бактерий.

Структурно-функциональные перестройки клеток бактерий в цикле развития и под влиянием факторов окружающей среды. Клеточный цикл и клеточная дифференциация в процессе онтогенетического развития бактерий. Способы размножения бактерий: бинарное деление, почкование и др. Покоящиеся, некультивируемые формы бактерий.

Эндоспоры, экзоспоры, цисты, миксоспоры, акинеты и гетероцисты бактерий, особенности их строения, образования, прорастания, рекультивации.

Строение клеток эукариотных микроорганизмов.

Жизненный и клеточный цикл. Размножение. Клеточная дифференциация.

Спорообразование у дрожжей и мицелиальных грибов. Инцистирование простейших.

Клеточная стенка и цитоплазматическая мембрана. Строение, химический состав, функции, синтез компонентов.

Эндоплазматический ретикулум. Структура и происхождение. Функция гладкого и шероховатого ретикулума. Связь мембран ретикулума с мембранами аппарата Гольджи, цитоплазматической и ядерной мембранами. Микросомы.

Аппарат Гольджи. Строение, функции и роль в синтезе мембран, лизосом и клеточной стенки. Лизосомы; вакуоли, фагосомы, сегрегационные и пищеварительные вакуоли. Пероксисомы. Структура, состав и функции.

Митохондрии. Строение, химический состав и функции; наружная и внутренняя мембраны, кристы, ДНК, белоксинтезирующий аппарат, гипотезы о происхождении митохондрий. Хлоропласты. Строение, химический состав и функция; наружная и внутренняя мембраны, тилакоиды, ДНК, белоксинтезирующий аппарат.

Цитоплазма. Состав и строение компонентой цитоплазмы. Гиалоплазия 'Запасные вещества: полифосфаты, углеводы, липид-ные гранулы, белковые кристаллы. Амебоидное движение. Рибосомы (строение, состав, функции). Микротрубочки и тонофиламенты, цитоскелет клетки. Жгутики и реснички.

Ядро. Ядерные структуры (строение и функции): мембрана, хромосомы, ядрышко, ядерный сок, Митоз, эндомитоз. Макро и микронуклеусы простейших.

Систематика микроорганизмов.

Мир микробов: доклеточные формы (вирусы - царство Viга) и клеточные формы (бактерии, архебактерии, грибы и простейшие). Домены «Васtеriа», «Агсhаеа», «Еисагуа».

Домен «Вас1еriа» - прокариоты (истинные бактерии, или эубактерии). Домен «Агсhаеа» - прокариоты (архебактерии) Домен «Еисагуа» - эукариоты: царство Fungi (грибы); царство Stramenoпорila, царство растений Р1аntае; царство животных Аnimalia с полцарством Ргоtоzоа (простейшие).

Систематика, классификация, таксономия, номенклатура, диагностика, идентификация. Таксономические категории, современные критерии вида и подвидовых категорий.

Использование фенотипических, генотипических и филогенетических показателей для идентификации и типирования бактерий:

1.ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ - окраска по Граму, морфологические и культуральные свойства, биохимические реакции, хромогенные ферментативные реакции, использование источников углевода, антибиотикограмма, бактериоцинотипирование, фаготипирование, антигенные свойства, химический состав клеточной стенки (пептидогликан, миколовая кислота и др.), а также белков и липидов клетки;

2.ГЕНОТИПИЧЕСКИЕ - соотношение G+С, гибридизация ДНК, молекулярное зондирование, плазмидный анализ, полиморфизм длины фрагментов рестрикции ДНК, риботипирование;

3.ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ - анализ рРНК-последовательности, РНК-РНК гибридизация, амплификация полиморфной ДНК с использованием производных праймеров, секвенирование 168 и 238 рРНК.

Группы бактерий, сформированные по фенотипическим признакам (Определитель бактерий Берджи, 1994; перевод с англ. 1997, 9 издание)

1.Спирохеты;

2.Аэробные/микроаэрофильные, подвижные, спиралевидные, вибриоидные, грамотрицательные бактерии;

3.Неподвижные или, редко, подвижные, грамотрицательпые, изогнутые бактерии;

4.Грамотрицательные, аэробные/микроаэрофильные палочки и кокки,

5.Факультативно анаэробные, грамотрицательные палочки;

6.Грамотрицательные, анаэробные, прямые, изогнутые и спиральные палочки;

7.Бактерии, осуществляющие диссимиляционное восстановление сульфата или серы;

8.Анаэробные грамотрицательные кокки;

9.Риккетсии и хламидии;

10.Аноксигенные фототрофные бактерии (содержат бактериохлорофилл);

11.Оксигенные фототрофные бактерии (содержат хлорофилл);

12.Аэробные хемолитотрофные бактерии и близкие организмы;

13.Почкующиеся и/или образующие выросты бактерии;

14.Бактерии, имеющие чехлы;

15.Нефотосинтезирующие скользящие бактерии, не образующие плодовые тела;

16.Скользящие бактерии, образующие плодовые тела;

17.Грамположительные кокки;

18.Образующие эндоспоры грамположительные палочки и кокки;

19.Грамположительные палочки правильной формы;

20.Грамположительные палочки неправильной формы;

21.Микобактерии;

22-29.Актиномицеты;

30.Микоплазмы (роды Мусор1аsmа, Ureaplasma, Асhо1еaр1аsmа и др.) 31-35.Архебактерии (метаногены, сульфатредуцирующие археи, галобактерии, архебактерии без клеточной стенки, термофилыи гипертермофилы, метаболизирующие 8°.

Классификация бактерий по генотипичсским и фенотипическим признакам.

(Веrgе's Маnuа1 оf Sуstеmаtiс Васtеriоlоgу 2nd. Edition 2001) Характеристика грамотрицательных бактерий, большинство которых по свойствам рРНК объединены в тип протеобактерий («Ргоtеоbасtеriа»). Характеристика грамположительных бактерий с двумя большими подотделами с высоким и низким соотношением (G+C) (генетическое сходство).

Характеристика домена «Bacteria», среди 22 типов которого имеют медицинское значение следующие:

Тип Proteobacteria Класс Alphaproteobacteria. Роды: Rickettsia, Orientia, Ehrlichia, Bartonella, Brucella Класс Betaproteobacteria. Роды: Burkholderia, Alcaligenes, Bordetella, Neisseria, Kingella, Spirillum Класс Gammaproteobacteria.

Роды: Francisella, Legionella, Coxiella, Pseudomonas, Moraxella, Acinetobacter, Vibrio, Enterobacter, Callimatobacterium, Citrobacter, Edwardsiella, Erwinia, Escherichia, Hafnia, Klebsiella, Morganella, Proteus, Providencia, Salmonella, Serratia, Shigella, Yersinia, Pasteurella Класс Deltaproteobacteria. Род: Bilophila Класс Epsilonproteobacteria. Роды: Campylobacter, Helicobacter, Wolinella Тип Firmicutes (главным образом грамположительные) Класс Clostridia. Роды: Clostridium, Sarcina, Peptostreptococcus, Eubactenum, Peptococcus, Veillonella (грамотрицательные) Класс Mollicutes. Роды: Mycoplasma, Ureaplasma Класс Bacilli. Роды: Bacillus, Sporosarcina, Listeria, Staphylococcus, Gemella, Lactobacillus, Pediococcus, Aerococcus, Leuconostoc, Streptococcus, Lactococcus Тип Actinobacteria Класс Actinobacteria. Роды: Actinomyces, Arcanodacterium, Mobiluncus, Micrococcus, Rothia, Stomatococcus, Corynebacterium, Mycobacterium, Nocardia, Propionibacterium, Bifidobacterium, Gardnerella Тип Clamydiae Класс Chlamydiae Роды: Chlamydia, Chlamydophila Тип Spirochaetes Класс Spirochaetes. Poды: Spirochaeta, Borrelia, Treponema, Leptospira Тип Bacteroidetes Класс Bacteroidetes. Роды: Bacteroides, Porphyromonas,Prevotella Класс Flavobacteria. Род: Flavobacterium Систематика грибов Принципы построения современных систем грибов. Основные таксономические критерии: наличие подвижных стадий, телеоморфы и типы полового процесса, анаморфы и типы бесполого размножения, особенности морфологии, химический состав клеточных структур, экологические ниши и биотопы, факторы вирулентности и др.

Характеристика грибов: хитридиомицеты (тип Chytridiomycota), зигомицеты (тип Zygomycota), аскомицеты (тип Ascomycota), базидиоми-цеты (тип Basidiomycota), формальный тип/группа - дейтеромицеты (Deiteromycota), или так наз. митоспоровые грибы. Особенности гифальных и дрожжевых грибов. Диморфизм грибов.

Царство Stramenopila, тип Oomycota; отличия их от грибов.

Систематика простейших Характеристика простейших, в том числе имеющих медицинское значение (типы Sarcomastigophora, Apicomplexa, Ciliophora, Microspora).

Систематика вирусов Характеристика оболочечных и безоболочечных вирусов; вирусы, имеющие двунитевую ДНК, однонитевую ДНК, плюс однонитевую РНК, минус однонитевую РНК, двунитевую РНК, идентичные плюс нитевые РНК (ретровирусы). Вирусы животных, грибов, растений, бактерий. Вирулентные и умеренные бактериофаги. Лизогения.

Рост и развитие микроорганизмов.

Питательные среды: элективные, дифференциально-диагностические, специальные, обогатительные, органические, неорганические, синтетические и др. Принципы и методы стерилизации посуды, сред, оборудования. Методы определения числа бактерий и их биомассы. Накопительные культуры. Чистые и смешанные культуры.

Особенности культивирования аэробов, анаэробов, психрофилов, мезофилов, термофилов, гемофилов, галофилов и других групп микроорганизмов.

Рост микроорганизмов. Периодические культуры и периодическое культивирование, фазы роста, методы культивирования. Параметры роста: скорость, время генерации и др. Проточное культивирование. Принципы работы хемостата, турбодостата. Синхронизированные культуры.

Понятие сбалансированного роста. Лимитирующие факторы. Торможение роста Типы питания микроорганизмов, физиологические группы.

Фото- и хемо-, ауто- и гетеро-, лито- и органотрофы. Метилотрофы. Аэробные литотрофные бактерии: водородные бактерии, нитрифицирующие бактерии, серные бактерии, железобактерии и др. Аэробы, микроаэрофилы, капнофилы, факультативные анаэробы, облигатные анаэробы. Аммонифицирующие, денитрофицирующие, сульфатредуцирующие, метанообразующие и др. бактерии. Микроорганизмыдеструкторы.

Прототрофы, ауксотрофы, паразиты, патогенные и условно-патогенные микроорганизмы, сапрофиты.

Биохимические основы жизнедеятельности микроорганизмов.

Методы разрушения микроорганизмов и получения фракций. Получение очищенных ферментов. Ферментные препараты.

Поступление источников питания в клетку: механизмы пассивной и облегченной диффузии; активный транспорт, транслокация радикалов.

Принципы использования органических соединений микроорганизмами. Основные пути утилизации углеводов - гексоз и пентоз (пути Эмбдена-Мейергофа, ЭнтнераДудорова, пентозофосфатный путь). Основные пути использования ароматических соединений и углеводородов.

Центральный метаболизм; основные циклы (цикл трикарбо-новых кислот, пентозофосфатный цикл, глиоксолатный шунт).

Энергетическая основа клеточного метаболизма. Субстратное фосфорилирование.

Брожение, типы и механизм. Фосфорилирование, механизм и разновидности.

Окислительное фосфорилирование, механизмы. Анаэробное дыхание, механизмы. ЛТФ и трансмембранный потенциал как энергетический резерв клетки. Разобщение окисления и фосфорилирования.

Биосинтетическне реакции у микроорганизмов. Ассимиляция углерода углекислоты микроорганизмами. Биосинтез аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований, витаминов. Биосинтез белка, жирных кислот и липидов, углеводов и полисахаридов. Биосинтез РНК и ДНК. Биосинтез пигментов, антибиотиков и др.

вторичных метаболитов. Биохимия ассимиляции азотсодержащих соединений.

Ферментный аппарат микроорганизмов. Эндо- и экзоферменты. Конститутивные и индуцибильные ферменты. Регуляция синтеза и активности. Практическое использование ферментов.

Регуляция метаболизма у микроорганизмов.

Регуляция ферментативных реакций; константы, влияние различных факторов.

Роль аллостерических белков.

Генетическая регуляция синтеза ферментов; механизмы. Опероны и регулоны.

Катаболитная репрессия и катаболитное торможение. Роль циклического АМФ, субклеточных структур и полиферментных комплексов в регуляции метаболизма. Роль изоферментов. Регуляция синтеза ДНК и РНК, полисахаридов, полифосфатов, липидов.

Генетика микроорганизмов.

Геномы микроорганизмов. Генетический код и синтез белка. Типы мутаций у микроорганизмов. Молекулярные механизмы генных мутаций. Системы генетической коррекции и репарации. Виды изменчивости. Модификационная и генотипическая изменчивость.

Генетические рекомбинации у прокариот. Конъюгация, трансформация, трансдукция. Методы локализации генов. Транспозоны, 1S-элементы. Свойства плазмид.

Рестрикция и модификация чужеродной ДНК. Методы генной инженерии.

Генетическая рекомбинация у эукариотических микроорганизмов. Методы селекции микроорганизмов. Применение молекулярно-генетических методов для индикации микробов и диагностики инфекций (ПЦР, методы гибридизации нуклеиновых кислот, зонды и др.). Достижение и перспективы генной инженерии.

Экология микроорганизмов.

Геохимическая деятельность микроорганизмов. Роль микроорганизмов в круговороте веществ в природе. Микробиоценозы. Симбиоз, комменсализм, нейтрализм, конкуренция, паразитизм, хищничество. Эндо-и эктосимбионты растений и животных.

Лишайники. Микориза. Микрофлора организма человека, животных, почвы, воды, воздуха. Функции микрофлоры. Колонизационная резистентность микрофлоры человека.

Дисбиоз, дисбактериоз. Понятия о пробиотиках, пребиотиках и симбиотиках.

Микробиологические показатели качества воды и других сред. Роль свободноживущих микроорганизмов в формировании и развитии биосферы Земли. Участие микробов в биогеохимических циклах химических элементов, синтезе и трансформации веществ, поддержании планетарного радиационного баланса. Микробиологические аспекты охраны окружающей среды. Болезни человека, животных, растений, вызываемые микроорганизмами. Факторы патогенности микроорганизмов, токсины. Взаимоотношения микроорганизмов с неспецифическими факторами защиты и факторами приобретенного иммунитета.

Микробная биотехнология Биотехнология как междисциплинарная область научно-технического прогресса.

Техническая микробиология и ее значение в развитии современной биотехнологии.

Роль микроорганизмов: в виноделии, при хлебопечении; в производстве молочных продуктов, этанола, глицерина, ацетона, бутанола, органических кислот, полисахаридов, аминокислот, гормонов, вакцин, антибиотиков, инсулина, иммуномодуляторов, энтомопатогенных препаратов и др. Методы получения и контроля штаммов-продуцентов биологически активных веществ. Методы очистки продуктов. Иммобилизованные биокатализаторы. Промышленные и лабораторные биореакторы. Основные виды сырья.

Биогеотехнология. Роль бактерий в получении металлов, в повышении нефтеотдачи пластов, в разрушении нефти и рекультивации нефтезагрязненных почв, водоемов, а также в снижении мета-ноопасности угольных пластов.

Требования к научно-исследовательской работе аспиранта

Научно-исследовательская часть программы должна:

соответствовать основной проблематике научной специальности, по которой защищается кандидатская диссертация;

быть актуальной, содержать научную новизну и практическую значимость;

основываться на современных теоретических, методических и технологических достижениях отечественной и зарубежной науки и практики;

использовать современную методику научных исследований;

базироваться на современных методах обработки и интерпретации данных с применением компьютерных технологий;

разрешения о выполнении научного исследования в соответствии с договорами;

содержать теоретические (методические, практические) разделы, согласованные с научными положениями, защищаемыми в кандидатской диссертации.

Требования к итоговой государственной аттестации аспиранта

Итоговая аттестация аспиранта включает сдачу кандидатских экзаменов (форма подтверждения освоения программы – удостоверение о сдаче кандидатских экзаменов) и представление диссертации на кафедру или в Диссертационный совет.

Порядок проведения кандидатских экзаменов устанавливается Положением о подготовке научно-педагогических кадров и научных кадров в системе послевузовского профессионального образования в Российской Федерации. Образовательные учреждения и научные организации, реализующие программы послевузовского профессионального образования, вправе включать в кандидатский экзамен по научной специальности дополнительные разделы, обусловленные спецификой научной специальности или характера подготовки аспиранта.

Требования к содержанию и оформлению диссертационной работы определяются Высшей аттестационной комиссией Министерства образования Российской Федерации (ВАК России).

Требования к итоговой государственной аттестации (порядок представления и защиты диссертации на соискание степени кандидата наук) разрабатываются Высшей аттестационной комиссией Министерства образования Российской Федерации (ВАК России) Дополнения и изменения в ООП ППО на 20___/20___ учебный год В ООП ППО Программа одобрена на заседании кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии «____» ___________20____г.

–  –  –



Похожие работы:

«№ 3 2014 г. 14.00.00 медицинские и фармацевтические науки УДК 612.111-097:616.155.194.18-053.31 ОСОБЕННОСТИ ЭРИТРОЦИТАРНЫХ АНТИГЕНОВ СИСТЕМЫ АВО У НОВОРОЖДЕННЫХ К. В. Алексанян, И. В. Андрюшина,...»

«(19) (11) (13) РОССИЙСКАЯ ФЕДЕРАЦИЯ RU 2 376 704 C2 (51) МПК H04B 7/005 (2006.01) H04B 1/30 (2006.01) ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА ПО ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ СОБСТВЕННОСТИ, ПАТЕНТАМ И ТОВАРНЫМ ЗНАКАМ (12) ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ К ПАТЕНТУ (21), (22) Заявка: 2004121685/09, 14.11.2003 (72) Автор(ы): ГАРД Кевин (US), (...»

«Саратовский научно-медицинский журнал Том8, 3 Июль сентябрь – Saratov Journal of Medical Scientific Research Volumе 8, № 3 July – September Саратовский научно-медицинский журнал 2012. том 8, № 3 июль–сентябрь Saratov Journal 2012 of Medical Volumе 8, № 3 Scientific Research July – September Учредитель жУрнала — Гл а...»

«И И :; ••'• ' •. '.. '..'•• ЧГ •*# 4 ? ЧР 4 F " *w Доктор РУДДОК. СПУТНИЕ ГОМШАТА (Vade Mecum.) РУКОВОДСТВО к*ь лечению болезней по способу гомеопатии. ПЕРЕВЕДЕН С ДЕВЯТАГО АНГЛИЙСКАГО ИЗДАНИЯ гг. А. I. Мальм и В. Я. Г е р д, под редакцией Главнаго врача Гомеопатической больницыв памятьИмператораАлександра II, дои^тора р. J3. р о л о в ь е в а. ИЗ...»

«Профилактика гриппа и ОРВИ: памятка населению Грипп — острое сезонное вирусное заболевание. Вирусы подразделяются на 3 типа: А, В и С, каждый имеет свои штаммы, что позволяет вирусу свободн...»

«Министерство здравоохранения Российской Федерации Санкт-Петербургский Государственный педиатрический медицинский Университет ЛАТИНСКИЙ ЯЗЫК ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ ТЕРМИНОЛОГИЯ Учебное пособие для с...»

«Улуханова Лала Уджаговна КЛИНИКО-ИММУНОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШИГЕЛЛЕЗОВ И САЛЬМОНЕЛЛЕЗОВ У ДЕТЕЙ. ОПТИМИЗАЦИЯ ТАКТИКИ ТЕРАПИИ (на примере РЕСПУБЛИКИ ДАГЕСТАН) 14.01.09 – инфекционные болезни Авторефер...»

«Разъяснения по отдельным вопросам, связанным с применением Положения Банка России от 16.07.2012 № 385-П "О правилах ведения бухгалтерского учета в кредитных организациях, расположенных на территории Российской Федерации", от 14.03.2016 Вопрос 1. Российская кредитная организация (далее – Банк), являющаяся материнской компанией Груп...»

«Заболевания с Х-сцепленным рецессивным типом наследования Грязнова Ю.Е. Тюменский государственный медицинский университет, Тюмень, Россия Disease with X-linked recessive mode of inheritance Gryaznova Y.E. Tyumen state medical University Tyumen, Russ...»

«ISSN 0494-7304 0207-4419 TARTU RIIKLIKU LIKOOLI CTMETTSRD УЧЕНЫЕ ЗАПИСКИ ТАРТУСКОГО Г О С У Д А Р С Т В Е Н Н О Г О У Н И В Е Р С И Т Е Т А ACTA ET COMMENTATION ES UNIVERS1TATIS TAR TUEN SI S АРМАЦЕВТИЧЕСКОЕ ИЗУЧЕНИЕ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ Труды по медицине TARTU Illil 19 8 7 TARTU RIIKLIKU LIKOOLI TOIMETISED УЧЕНЫЕ ЗАПИСКИ...»

«75 ISSN 1561-8641 САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКОЕ ОБЩЕСТВО КАРДИОЛОГОВ ИМ. Г.Ф.ЛАНГА ФГУ "ФЦ СЕРДЦА, КРОВИ И ЭНДОКРИНОЛОГИИ ИМ. В.А.АЛМАЗОВА РОСМЕДТЕХНОЛОГИЙ" ИНСТИТУТ КАРДИОЛОГИЧЕСКОЙ ТЕХНИКИ ОФИЦИАЛЬНЫЙ Ж...»

«КАТАЛОГ ПРОДУКЦИИ Биотек лидер в области управляемой костной регенерации О компании Итальянское предприятие Биотек было создано в начале девяностых годов. Компания производит широкий спектр костных заменителей и занимается...»








 
2017 www.doc.knigi-x.ru - «Бесплатная электронная библиотека - различные документы»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.